机构设置
办公室
主要职责：承担所党建与精神文明；人事与人才、劳资、工青妇管理；基建、安全、采购、固定资产（实物）、公车、公房、水电、维修与维护；公文、公章、档案、会议会务、网络与宣传、集体户、因私出国（境）等综合管理工作。承办所领导交办的其他工作。
联系电话：85161061
科技科
主要职责：承担科技管理工作，负责科技项目与成果管理、科技服务与科技成果转化管理、科技合作与交流、学科团队与研究生管理、重点实验室等条件平台运行管理、承办所领导交办的工作。
联系电话：85161062
财务科
主要职责：财务管理工作。
联系电话：85161106
技术推广服务中心
主要职责：承担检测业务相关的咨询和管理工作；实验室质量管理体系运行；检测机构考核和资质认定咨询认证服务；承办所领导交办的其他检测业务相关工作。
联系电话：85161060/85161430
检测业务联系电话：85161431
农产品监测研究室
主要职责如下：承担蔬果、畜禽产品、水产品及饲料等营养品质及安全指标检测服务；农药残留、兽药残留及营养品质检测技术培训服务；农药登记残留试验技术服务；农产品及投入品检测技术及装备研发与推广。
种植业产品风险评估课题组：负责种植业产品质量安全保障与控制技术研究；高通量、快速检测技术及产品开发与评价；农药行为规律及环境安全风险评估研究。
养殖业产品风险评估课题组：负责饲料和兽药质量安全保障和控制新技术研究；动物产品风险因子非靶向筛查、定量确证技术研究；动物产品风险因子全程控制技术研究；动物细菌耐药性的传播机制及控制技术研究；承办所领导交办的其他工作。
联系电话：85161406
产地环境监测研究室
主要职责如下：承担土壤、肥料、水质、食品、饲料等检测服务及检测技术培训；绿色食品、有机食品、地理标志农产品产地认证环境监测；产地环境相关检测技术及装备研发与推广。
农田安全利用课题组：负责农田污染源解析；污染物在土壤-作物中的吸收转运机理研究；农业投入品对土壤和农产品质量的影响评估；受污染耕地安全利用技术集成与推广。
环境绿色发展课题组：负责环境绿色发展与农产品品质提升技术研究与应用；土壤有机物-矿物-微生物多组分互作的减污固碳过程；畜禽养殖污水复合生态循环利用技术研究与应用。
联系电话：85161203
农产品质量安全控制研究室
主要职责：承担农产品及产地环境中新污染物监控技术及风险评估；农产品中真菌毒素风险评估、控制技术及产品开发；水产品质量安全控制技术；转基因植物及其产品成分的检测。
生物安全控制技术课题组：负责水稻养分高效利用、逆境响应相关基因的克隆与生产利用；关键生理生化过程以及相关调控基因的分子作用机理剖析；重金属等有毒物质阻控技术、稻米品质提升技术研发；高效、高抗、优质水稻的创制和品种培育；承办所领导交办的其他工作。
联系电话：85161583
农产品标准与法规研究室
主要职责：承担国家、行业、地方、团体及企业等各类标准制修订；团体标准的立项发布管理及全程技术指导；农业全产业链标准体系与基地创建指导与培训；农业科技、信息等成果标准化研究与示范推广。负责国家特色蔬菜水果标准化区域服务与推广平台、广东省种植业标准化技术委员会（GD/TC48）、广东省农业标准化协会等平台的日常管理。
联系电话：85161829
品质评价研究室
主要职责：承担绿色食品、有机食品、地理标志农产品、全国名特优新农产品（特质农品）、良好农业规范（GAP）等品牌创建及配套生产技术指导；农产品营养品质评价鉴定、特征物质挖掘、真伪鉴别技术开发与服务。
联系电话：85279452