动卫所在广东省人工驯养竹鼠携带圆环病毒遗传多样性与跨种传播研究方面取得新进展
近日，动卫所在农林科学期刊Transboundary and Emerging Diseases（兽医学一区，IF=4.3）发表了题为“The Genetic Diversity and Interspecific Transmission of Circovirus in Rhizomys sinensisin Guangdong, Southern China”的研究性论文。研究团队在前期揭示了人工繁育竹鼠可携带多种啮齿类冠状病毒以及存在犬冠状病毒的跨种间传播（X.H. Wang. et al. Virus Evol. 2022）之后，该文进一步揭示了其携带重组体圆环病毒的遗传多样性与跨种传播事件，拓展了对竹鼠中圆环病毒的遗传多样性与跨种传播的认识。动卫所与华南农业大学联合培养的博士研究生任照文，袁子国教授、罗胜军副研究员为论文共同第一作者，王晓虎研究员和廖明教授为论文共同通讯作者。
啮齿动物（啮齿目，Rodentia）是全球分布最广泛，种类最多的哺乳动物，有33科2277种（约占所有哺乳动物物种的43%）。竹鼠作为啮齿动物的一种，主要分布于中国南方，以竹子、芒草和植物茎秆等为食。该研究团队利用病毒宏转录组测序、全基因组测序和生物信息学分析等方法展示了广东省人工驯养竹鼠体内的病毒组结构特征。研究结果显示，广东省竹鼠种群携带的病毒reads覆盖了22个病毒科，包含了大量的DNA病毒，其中圆环病毒科成员占据主导地位，其reads总数超过总病毒reads的75%。利用全基因组测序和生物信息学分析发现，广东省的竹鼠体内携带了3种圆环病毒，其中竹鼠圆环病毒（Bamboo rat circovirus）流行率最高，达64.1%（125/195）。目前，竹鼠圆环病毒分为3个进化支，不同的进化支在特定位点存在核苷酸替换规律，这很可能是该病毒进化分群的关键。同时，研究团队首次从竹鼠种群中分离到猪圆环病毒2（PCV2），属于PCV2d。这一发现将有助于进一步理解PCV2的宿主范围、遗传进化和流行病学，也为PCV2可通过啮齿动物传播提供直接数据。此外，文章还监测到竹鼠体内可能存在一种新的圆环病毒，且种群的流行率较高（44.1%），与骆驼、蝙蝠和鲸鱼来源的圆环病毒具有较近的亲缘关系。
本研究得到了广东省林业局自然资源事务（生态林业建设）专项资金项目、广东省科技规划基金（2021B1212050021）、广东省农业科学研究院协同创新中心项目（XTXM202202）、广州市科技计划项目（2023E04J1256）等资助。
原文链接：https://doi.org/10.1155/2023/6668569
