动卫所在猪A群轮状病毒遗传多样性研究方面取得新进展
近日，动卫所在国际期刊Animals（中科院大类二区）发表了题为“Emergence of a Novel G4P[6] Porcine Rotavirus with Unique Sequence Duplication in NSP5 Gene in China”的研究性论文，揭示了猪A群轮状病毒（porcine Rotavirus A，PoRVA）的遗传多样性与潜在的猪与人RVA基因重配现象，拓展了对RVA基因组学的认识。动卫所猪病研究室周霞博士为论文第一作者，动卫所猪病研究室翟少伦研究员和新疆畜牧科学院兽医研究所魏玉荣研究员为论文共同通讯作者。
轮状病毒（Rotavirus，RV）是一种引起幼龄动物和婴幼儿急性肠胃炎的人兽共患病病原体，特别是在发展中国家，每年可造成约45万名5岁以下儿童死亡。猪轮状病毒（Porcine rotavirus，PoRV）是引起仔猪病毒性腹泻的主要病原体之一，仔猪感染PoRV后迅速发生腹泻，严重者常常因脱水而死亡。RV由11个分段的RNA片段构成，分别编码6个结构蛋白（VP1、VP2、VP3、VP4、VP6、VP7）和5或6个非结构蛋白（NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5/6）。其中，大多数NSP5基因片段的长度约为667 bp，大于667 bp的NSP5基因片段非常罕见，特别是在中国，到目前为止，国内仅报道了一株兔RV G3P[14]毒株（N5），其NSP5基因片段含有946个核苷酸。
该研究团队利用病毒全基因组测序和生物信息学方法，在广东省的一头患腹泻仔猪中鉴定出1株具有较长NSP5基因的PoRVA独特毒株，命名为RVA/Pig-tc/CHN/S2CF/2023/G4P[6]，完整基因型为G4-P[6]-I1-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1，该毒株在NSP5基因的3’末端非编码区存在一段含有344个核苷酸的重复序列。同时，还发现该毒株的11个基因片段中有4个（VP4、VP6、VP2和NSP5）基因片段的核苷酸相似性与人源轮状病毒最高，表明猪与人轮状病毒之间存在潜在的种间传播。RV基因序列分节段的特性是导致新毒株出现和种间传播的重要原因，因此，文章再次提出了对RV的11个片段进行基因组分析的必要性，以便为RV的种间传播和溯源提供重要的理论基础。
图1. S2CF毒株NSP5基因重复序列插入位点示意图
本研究得到了广东省农业科学院“金颖之光”项目、新疆动物疫病研究重点实验室项目、广州市重点研发项目、广东省畜禽疫病防治研究重点实验室项目和广东省农业农村厅项目等资助。
原文链接：https://www.mdpi.com/2076-2615/14/12/1790