动卫所科研人员在猪新发病原—盖塔病毒鉴定方面取得新进展
近日，动卫所科研人员在国际期刊Microbiology
Spectrum（中科院大类二区）发表题为“Emergence
of a novel GIII Getah virus variant in pigs in Guangdong,
China, 2023”的研究性论文，该研究从广东省某发病猪场分离鉴定了一株盖塔病毒，并进行了全基因组测序和生物信息学分析，发现该病毒株属于GⅢ基因型。动卫所猪病研究室楚品品、复旦大学郭宏元、动卫所猪病研究室周霞等为论文共同第一作者，动卫所猪病研究室翟少伦研究员和复旦大学张荣研究员为论文共同通讯作者。
发病猪临床表现和盖塔病毒GDHYLC23毒株分离鉴定
盖塔病毒（Getah virus，GETV）隶属于披膜病毒科（Togaviridae）甲病毒属（Alphavirus），是一种由蚊虫传播的虫媒病毒，可在蚊子体内增殖并通过叮咬传播给宿主动物，感染了GETV的宿主动物又成为传染源被未感染蚊子叮咬，又传回蚊子，形成“蚊子-宿主动物-蚊子”的循环模式。盖塔病毒宿主范围广泛，目前发现的潜在感染宿主动物高达19种，甚至在人类中也检测到GETV中和抗体的存在。盖塔病毒感染宿主猪后，主要临床表现为发热、腹泻和繁殖障碍，严重时甚至引起患病仔猪死亡。近年来盖塔病毒引起猪病相关报道持续增加，给养猪业造成巨大的损失。
盖塔病毒属于RNA病毒，其核酸为单股正链RNA，基因组由5′非编码区、两个开放阅读框（Open Reading Frame, ORF，ORF1和ORF2，分别编码非结构蛋白和结构蛋白）和3′非编码区组成，其中3′非编码区极少出现连续碱基的缺失或插入。本研究从发生母猪流产，发情异常，腹泻，新生仔猪体温过低、水肿、共济失调和死亡的猪场分离到一株猪盖塔病毒，命名为GDHYLC23，并利用病毒全基因组测序和生物信息学方法，获得病毒全基因组并对其进行分析，结果显示该病毒株属于GⅢ基因型，序列比对分析发现在其紧临ORF1的3′非编码区处存在一段较长插入，长度为32bp，该片段插入目前尚未见报道。该毒株的发现拓展了对猪盖塔病毒多样性以及变异性的认知，为引起相关猪病的研究奠定了基础。
GDHYLC23毒株3′非编码区序列比对分析和基因组遗传进化树
本研究得到国家自然科学基金项目、广东省重点领域研发计划、广东省农业科学院项目、上海市重大科技专项项目、上海市优秀学术带头人计划和广东省农业农村厅项目等资助。
原文链接：https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.00483-24