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动卫所在猪德尔塔冠状病毒遗传演化方面取得新进展
近日，动卫所联合华南农业大学等单位撰写题为“Phylogeography and evolutionary dynamics analysis of porcine delta-coronavirus with host expansion to humans”的研究论文在兽医权威期刊《Transboundary and Emerging Diseases》（Top一区期刊）在线发表（论文网址：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503）。华南农业大学兽医学院博士研究生李根、广东省农业科学院动物卫生研究所翟少伦研究员、我院拟进站博士后周霞博士为论文共同第一作者，华南农业大学兽医学院贺东生教授和陈瑞爱教授为共同通讯作者。
猪德尔塔冠状病毒（PDCoV），又名猪丁型冠状病毒，是具有包膜的单股正链RNA病毒，与新冠肺炎病毒（SARS-CoV-2）同属于冠状病毒科，是已知RNA病毒中基因组最大的一类病毒。PDCoV于2012年首次在香港猪群中被发现。2014年在美国各大猪场暴发该病，并随后流行于世界各地，包括我国（图1）。之后，多篇动物试验研究证实PDCoV可感染鸡、火鸡、犊牛等，并表现出轻度腹泻症状。2021年，Nature杂志还发表了PDCoV感染海地儿童的论文。在新冠肺炎大流行期间，人类高度关注包括PDCoV在内的动物冠状病毒跨物种传播。
图1 PDCoV在世界的流行分布
遗传进化分析表明本研究分离的和已知的所有PDCoV毒株可分为中国谱系、美国谱系和东南亚等三大谱系（图2）；重建的PDCoV全球空间扩散网络研究显示PDCoV起源于1996年左右的亚洲，2007年左右传播到美国，然后蔓延到东亚和南美洲，海地人感染的PDCoV最有可能源自美国（图3、图4）。
图2 PDCoV遗传进化分析
图3 PDCoV全基因组的历史演化分析
图4 PDCoV空间扩散
