蔬菜所在茄子果皮颜色遗传研究方面取得新进展
近日,蔬菜所茄果类研究团队在国际期刊Horticulture Research(中科院一区,Top,IF=7.291)上在线发表题为“Mapping and validation of the epistatic D and P genes controlling anthocyanin biosynthesis in the peel of eggplant (Solanum melongena L.) fruit”的研究论文。蔬菜所游倩副研究员、已毕业硕士研究生李慧敏和吴俊为论文的共同第一作者,孙保娟研究员、李植良研究员,以及华南农业大学园艺学院孙光闻副教授为论文的共同通讯作者。
茄子是重要的茄果类蔬菜,是WHO推荐的世界十大健康蔬菜之一。茄子果皮颜色丰富多样,有紫黑、紫红、绿、白、粉红等颜色,不同区域对果色选择具有不同的消费习惯。茄子果色是决定商品外观品质和价值的重要因素之一,因此,果色一直是茄子育种过程中的一个重要选育目标。该团队在育种过程中发现茄子果色上位性遗传效应:两个白色果茄子亲本杂交,其F1代为紫红果,F2代中紫红果和白色果单株分离比符合9﹕7。
本研究基于F2群体构建高密度遗传图谱,将具有上位性效应的基因D和P定位在8号和10号染色体上;通过定位区间基因功能注释,结合亲本全基因组重测序和RNA-Seq数据分析,确定转录因子SmMYB1和结构基因SmANS分别为D和P位点的候选基因;基于病毒诱导的基因沉默(VIGS)和过表达试验初步验证了两个候选基因在茄子花青素合成中的作用;最后开发了3个与果色性状高度连锁的功能性分子标记(SmANS-Chr08SNP、SmMYB1-Chr10InDel1和SmMYB1-Chr10InDel6)。本研究解析了茄子果色上位性遗传的分子基础,为选育不同果色茄子新品种提供了可用的分子标记,并对茄子果色上位Y基因的定位具有一定的借鉴意义。
本研究在国家自然科学基金(31501755)、广东省现代农业产业技术体系(2021KJ110,2021KJ106)、广东省自然科学基金(2021A1515012490)、广东省农业科学院农业优势产业学科团队建设项目(202114TD,R2020PY-JX003)等项目的共同资助下完成。(游倩供稿)
文章链接:
https://academic.oup.com/hr/advance-article/doi/10.1093/hr/uhac268/6865348
图1两亲本、F1和F2的果皮颜色和花青素含量测定及QTL定位
图2 候选基因SmANS、SmMYB1的VIGS沉默和过表达结果