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环艺所在花叶芋叶片重要观赏性状关联分析和叶绿体基因组方面取得新进展

时间:2022-12-16 17:18 来源:环艺所 【字体:

  近日,环艺所特色花卉研究室在国际期刊Physiologia Plantarum(中科院2区,IF=5.081)发表题为“Diversity, classification, and EST-SSR-based association analysis of Caladium ornamental traits”的研究论文,环艺所周熠玮博士和叶远俊博士为论文的共同第一作者,环艺所刘金梅副研究员为论文的通讯作者。在Genes(中科院3区,IF=4.141)发表题为“Complete Chloroplast Genome Sequences of Four Species in the CaladiumGenus: Comparative and Phylogenetic Analyses”的研究论文,环艺所叶远俊博士为论文的第一作者,环艺所徐晔春研究员为论文的通讯作者。

  花叶芋(Caladium × Hortulanum Birdsey) ,是天南星科花叶芋属多年生草本植物,被誉为“观叶皇后”。花叶芋资源丰富,表型性状变异丰富,国内外主要集中在栽培育种、组培快繁、标记开发等研究,关于叶片重要观赏性状的关联分析和基于叶绿体基因组学的系统发育研究还未见报道。

  研究团队对144份花叶芋种质的叶片12个主要观赏性状进行了观测,利用26个多态性好的SSR标记对144份种质进行基因分型,群体结构分析表明144份材料可分为三个组,且与品种的地理来源显著相关。对标记分型数据和主要观赏性状表型数据进行了关联分析,鉴定出2、1、1、1、1和1个SSR标记分别与叶柄颜色、主脉颜色、叶片光泽以及叶片颜色的C、b*和L*显著相关(p<0.01)。这些与性状关联的位点为花叶芋的分子标记辅助选择育种奠定了基础。 

  研究以4个不同花叶芋原生种(Caladium bicolor、Caladium humboldtii、Caladium praetermissum和Caladium lindenii)为材料,利用高通量测序对其叶绿体基因组进行测序、组装和注释,并分析叶绿体基因组IR 边界、间隔区信息位点的特征,研究遗传多样性和系统发育关系,为花叶芋的种质资源的鉴定、开发和利用提供一定的理论依据。

  该两项工作获得国家留学基金项目、广东省农业科学院协同创新中心项目和广东省省级科技计划项目资助。

  原文链接:

  https://doi.org/10.1111/ppl.13841

  https://www.mdpi.com/2073-4425/13/12/2180

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